+49 9632/ 9248 325
info@biovariance.de
facebook twitter xing linked in
Logo
  • Produkte und Services

    • Pharma

    • Kliniken

    • Patienten
  • Technologie
    • Pillbox
    • OncoVariant
  • News
    • Veranstaltungen
    • Blog
  • Über uns
    • Firmenüberblick
    • Team
    • Geschichte
  • Karriere
  • de
  • en
here
  • Produkte und Services

    • Pharma

    • Kliniken

    • Patienten
  • Technologie
    • Pillbox
    • OncoVariant
  • News
    • Veranstaltungen
    • Blog
  • Über uns
    • Firmenüberblick
    • Team
    • Geschichte
  • Karriere
  • de
  • en
  • Home »
  • Projekte »
  • Validierung von PCR Oligos für SARS-CoV-2 Nachweis

Validierung von PCR Oligos für SARS-CoV-2 Nachweis

Veröffentlicht: 7. Juli 2020

Die globale SARS-CoV-2 Pandemie breitet sich schnell und unaufhaltsam aus. Während noch an einer Impfung geforscht wird, ist eine Erhöhung der Test-Kapazitäten von größter Bedeutung, um Infektionsherde schnell zu lokalisieren und einzudämmen. Die BioVariance GmbH hat ihren Teil dazu beigetragen, indem Sie eine weltweit agierende in-vitro Diagnostik-Firma bei der FDA-Zulassung eines neuen und schnellen COVID-19 PCR-Tests unterstützt hat. Dies konnte durch computergestützte (in-silico) Validierungsmethoden und das Engagement unseres Teams aus Daten-Spezialisten in Rekordzeit umgesetzt werden. Im Rahmen dieses Projekts konnten zwei Anforderungen der FDA (Food and Drug Administration) erfüllt werden:

Sensitivität der Primer und Proben

Um die Sensitivität der Oligonukleotide des COVID-19 Tests zu bestätigen, wurden die Sequenzen mit allen öffentlich verfügbaren SARS-CoV-2 Sequenzen aligned. Im Anschluss wurde die Trefferliste nach Qualitätskriterien (z. B. E-Wert) sortiert, gefiltert und beurteilt. Desweiteren wurde sichergestellt, dass die Bildung eines PCR-Produktes potentiell möglich ist.

 

Abb. 1: Alignment von SARS-CoV-2 Sequenzen.

 

Prognose der Kreuz-Reaktivität

Um eine Kreuz-Reaktivität vorherzusagen und möglichst auszuschließen, wurden die Sequenzhomologien zwischen den Oligonukleotiden und den Genomen des Menschen, verwandten Coronaviren und Pathogenen der Atemwege ermittelt. So können potentiell falsch-positive PCR-Ergebnisse vorhergesagt werden und die Primer und Proben können optimiert werden, bevor möglicherweise Zeit und Ressourcen im Labor verschwendet werden.

 

Abb. 2: Flussdiagramm der Beurteilung von Sequenzhomologien

Ihre Vorteile in der Zusammenarbeit mit uns:

  • In-silico Nachweis der analytischen Spezifität und Exklusivität Ihrer Oligonukleotide
  • Untermauerung Ihrer Zulassungsanträge
  • Einsparung von Ressourcen und Arbeitszeit im Labor
  • Nachweis von Mutationen wie z. B. Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)
  • Detaillierter Abschlussbericht in wissenschaftlicher Qualität inkl. überzeugender Grafiken

Wenn Sie Interesse oder Fragen haben, zögern Sie nicht uns zu kontaktieren. Wir freuen uns auf ein Gespräch mit Ihnen.

Kontaktperson:
Helen Rießbeck | Abteilung: Vertrieb
helen.riessbeck@biovariance.com

Zurück zur Übersicht:
facebook twitter xing linked in

Impressum Datenschutz Haftungsausschluss Cookies

Hauptanschrift
BioVariance GmbH
Konnersreuther Str. 6g
95652 Waldsassen
Tel.: +49 9632/9248325
info@biovariance.com
Bleiben Sie in Verbindung
facebook twitter xing linked in